Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

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Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nrf1Q9WU00 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nrf1Q9WU00 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nrf1Q9WU00 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nrf1Q9WU00 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nrf1Q9WU00 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nrf1Q9WU00 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nrf1Q9WU00 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nrf1Q9WU00 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nrf1Q9WU00 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nrf1Q9WU00 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nrf1Q9WU00 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nrf1Q9WU00 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nrf1Q9WU00 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nrf1Q9WU00 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nrf1Q9WU00 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nrf1Q9WU00 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nrf1Q9WU00 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nrf1Q9WU00 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nrf1Q9WU00 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nrf1Q9WU00 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nrf1Q9WU00 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nrf1Q9WU00 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nrf1Q9WU00 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nrf1Q9WU00 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nrf1Q9WU00 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nrf1Q9WU00 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nrf1Q9WU00 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nrf1Q9WU00 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nrf1Q9WU00 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Nrf1Q9WU00 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Nrf1Q9WU00 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nrf1Q9WU00 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Nrf1Q9WU00 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nrf1Q9WU00 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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