Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Fam50bQ9WTJ8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fam50bQ9WTJ8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fam50bQ9WTJ8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fam50bQ9WTJ8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fam50bQ9WTJ8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fam50bQ9WTJ8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fam50bQ9WTJ8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fam50bQ9WTJ8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fam50bQ9WTJ8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fam50bQ9WTJ8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fam50bQ9WTJ8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fam50bQ9WTJ8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fam50bQ9WTJ8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fam50bQ9WTJ8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fam50bQ9WTJ8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fam50bQ9WTJ8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fam50bQ9WTJ8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fam50bQ9WTJ8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fam50bQ9WTJ8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fam50bQ9WTJ8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fam50bQ9WTJ8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fam50bQ9WTJ8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fam50bQ9WTJ8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Fam50bQ9WTJ8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fam50bQ9WTJ8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Fam50bQ9WTJ8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fam50bQ9WTJ8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fam50bQ9WTJ8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fam50bQ9WTJ8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fam50bQ9WTJ8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fam50bQ9WTJ8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fam50bQ9WTJ8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Fam50bQ9WTJ8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fam50bQ9WTJ8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fam50bQ9WTJ8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fam50bQ9WTJ8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fam50bQ9WTJ8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fam50bQ9WTJ8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fam50bQ9WTJ8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fam50bQ9WTJ8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fam50bQ9WTJ8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fam50bQ9WTJ8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Fam50bQ9WTJ8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Fam50bQ9WTJ8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Fam50bQ9WTJ8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fam50bQ9WTJ8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fam50bQ9WTJ8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fam50bQ9WTJ8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fam50bQ9WTJ8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fam50bQ9WTJ8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Fam50bQ9WTJ8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fam50bQ9WTJ8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fam50bQ9WTJ8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fam50bQ9WTJ8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fam50bQ9WTJ8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fam50bQ9WTJ8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fam50bQ9WTJ8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fam50bQ9WTJ8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fam50bQ9WTJ8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fam50bQ9WTJ8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fam50bQ9WTJ8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Fam50bQ9WTJ8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fam50bQ9WTJ8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fam50bQ9WTJ8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fam50bQ9WTJ8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fam50bQ9WTJ8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fam50bQ9WTJ8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fam50bQ9WTJ8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fam50bQ9WTJ8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fam50bQ9WTJ8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fam50bQ9WTJ8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fam50bQ9WTJ8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fam50bQ9WTJ8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fam50bQ9WTJ8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fam50bQ9WTJ8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fam50bQ9WTJ8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fam50bQ9WTJ8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fam50bQ9WTJ8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fam50bQ9WTJ8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fam50bQ9WTJ8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fam50bQ9WTJ8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Fam50bQ9WTJ8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fam50bQ9WTJ8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fam50bQ9WTJ8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fam50bQ9WTJ8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fam50bQ9WTJ8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fam50bQ9WTJ8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fam50bQ9WTJ8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fam50bQ9WTJ8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fam50bQ9WTJ8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fam50bQ9WTJ8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fam50bQ9WTJ8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fam50bQ9WTJ8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fam50bQ9WTJ8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fam50bQ9WTJ8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Fam50bQ9WTJ8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fam50bQ9WTJ8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fam50bQ9WTJ8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms