Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P3

Psmb2, Proteasome subunit beta type-2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb2Q9R1P3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb2Q9R1P3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb2Q9R1P3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb2Q9R1P3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb2Q9R1P3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb2Q9R1P3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb2Q9R1P3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psmb2Q9R1P3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Psmb2Q9R1P3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psmb2Q9R1P3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms