Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Psmb3Q9R1P1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psmb3Q9R1P1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Psmb3Q9R1P1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms