Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Plod3Q9R0E1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Plod3Q9R0E1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Plod3Q9R0E1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Plod3Q9R0E1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Plod3Q9R0E1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Plod3Q9R0E1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Plod3Q9R0E1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Plod3Q9R0E1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Plod3Q9R0E1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Plod3Q9R0E1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Plod3Q9R0E1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Plod3Q9R0E1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Plod3Q9R0E1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Plod3Q9R0E1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Plod3Q9R0E1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Plod3Q9R0E1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Plod3Q9R0E1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Plod3Q9R0E1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Plod3Q9R0E1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Plod3Q9R0E1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Plod3Q9R0E1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Plod3Q9R0E1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Plod3Q9R0E1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Plod3Q9R0E1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Plod3Q9R0E1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Plod3Q9R0E1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Plod3Q9R0E1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Plod3Q9R0E1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Plod3Q9R0E1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Plod3Q9R0E1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Plod3Q9R0E1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Plod3Q9R0E1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Plod3Q9R0E1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Plod3Q9R0E1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Plod3Q9R0E1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Plod3Q9R0E1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Plod3Q9R0E1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Plod3Q9R0E1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Plod3Q9R0E1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Plod3Q9R0E1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Plod3Q9R0E1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Plod3Q9R0E1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Plod3Q9R0E1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Plod3Q9R0E1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Plod3Q9R0E1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Plod3Q9R0E1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Plod3Q9R0E1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Plod3Q9R0E1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Plod3Q9R0E1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Plod3Q9R0E1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Plod3Q9R0E1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Plod3Q9R0E1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Plod3Q9R0E1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Plod3Q9R0E1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Plod3Q9R0E1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128 ms