Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vav3Q9R0C8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vav3Q9R0C8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vav3Q9R0C8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vav3Q9R0C8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vav3Q9R0C8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vav3Q9R0C8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vav3Q9R0C8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vav3Q9R0C8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vav3Q9R0C8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vav3Q9R0C8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vav3Q9R0C8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vav3Q9R0C8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Vav3Q9R0C8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vav3Q9R0C8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vav3Q9R0C8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vav3Q9R0C8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vav3Q9R0C8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vav3Q9R0C8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vav3Q9R0C8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vav3Q9R0C8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vav3Q9R0C8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vav3Q9R0C8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vav3Q9R0C8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vav3Q9R0C8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vav3Q9R0C8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vav3Q9R0C8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Vav3Q9R0C8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vav3Q9R0C8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vav3Q9R0C8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vav3Q9R0C8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vav3Q9R0C8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vav3Q9R0C8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vav3Q9R0C8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vav3Q9R0C8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vav3Q9R0C8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vav3Q9R0C8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vav3Q9R0C8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vav3Q9R0C8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vav3Q9R0C8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vav3Q9R0C8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Vav3Q9R0C8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vav3Q9R0C8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vav3Q9R0C8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vav3Q9R0C8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vav3Q9R0C8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vav3Q9R0C8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vav3Q9R0C8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vav3Q9R0C8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vav3Q9R0C8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vav3Q9R0C8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vav3Q9R0C8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vav3Q9R0C8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vav3Q9R0C8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms