Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Lamc3Q9R0B6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Lamc3Q9R0B6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Lamc3Q9R0B6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Lamc3Q9R0B6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Lamc3Q9R0B6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Lamc3Q9R0B6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Lamc3Q9R0B6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Lamc3Q9R0B6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Lamc3Q9R0B6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
Lamc3Q9R0B6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Lamc3Q9R0B6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Lamc3Q9R0B6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Lamc3Q9R0B6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Lamc3Q9R0B6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Lamc3Q9R0B6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Lamc3Q9R0B6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Lamc3Q9R0B6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Lamc3Q9R0B6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Lamc3Q9R0B6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Lamc3Q9R0B6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Lamc3Q9R0B6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Lamc3Q9R0B6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Lamc3Q9R0B6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Lamc3Q9R0B6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Lamc3Q9R0B6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Lamc3Q9R0B6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Lamc3Q9R0B6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Lamc3Q9R0B6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Lamc3Q9R0B6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Lamc3Q9R0B6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Lamc3Q9R0B6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Lamc3Q9R0B6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Lamc3Q9R0B6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Lamc3Q9R0B6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Lamc3Q9R0B6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Lamc3Q9R0B6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Lamc3Q9R0B6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Lamc3Q9R0B6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Lamc3Q9R0B6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Lamc3Q9R0B6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Lamc3Q9R0B6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Lamc3Q9R0B6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Lamc3Q9R0B6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Lamc3Q9R0B6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Lamc3Q9R0B6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Lamc3Q9R0B6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Lamc3Q9R0B6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Lamc3Q9R0B6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Lamc3Q9R0B6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Lamc3Q9R0B6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Lamc3Q9R0B6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Lamc3Q9R0B6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Lamc3Q9R0B6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Lamc3Q9R0B6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Lamc3Q9R0B6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Lamc3Q9R0B6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Lamc3Q9R0B6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Lamc3Q9R0B6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Lamc3Q9R0B6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Lamc3Q9R0B6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Lamc3Q9R0B6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Lamc3Q9R0B6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Lamc3Q9R0B6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Lamc3Q9R0B6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Lamc3Q9R0B6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Lamc3Q9R0B6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Lamc3Q9R0B6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Lamc3Q9R0B6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Lamc3Q9R0B6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Lamc3Q9R0B6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Lamc3Q9R0B6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Lamc3Q9R0B6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Lamc3Q9R0B6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
Lamc3Q9R0B6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Lamc3Q9R0B6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Lamc3Q9R0B6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Lamc3Q9R0B6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Lamc3Q9R0B6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Lamc3Q9R0B6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Lamc3Q9R0B6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Lamc3Q9R0B6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Lamc3Q9R0B6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Lamc3Q9R0B6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Lamc3Q9R0B6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Lamc3Q9R0B6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Lamc3Q9R0B6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Lamc3Q9R0B6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Lamc3Q9R0B6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Lamc3Q9R0B6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Lamc3Q9R0B6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Lamc3Q9R0B6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Lamc3Q9R0B6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Lamc3Q9R0B6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Lamc3Q9R0B6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Lamc3Q9R0B6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Lamc3Q9R0B6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Lamc3Q9R0B6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Lamc3Q9R0B6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Lamc3Q9R0B6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.1 ms