Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AmfrQ9R049 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AmfrQ9R049 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AmfrQ9R049 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AmfrQ9R049 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AmfrQ9R049 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AmfrQ9R049 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AmfrQ9R049 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AmfrQ9R049 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AmfrQ9R049 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AmfrQ9R049 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
AmfrQ9R049 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AmfrQ9R049 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AmfrQ9R049 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AmfrQ9R049 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AmfrQ9R049 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AmfrQ9R049 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AmfrQ9R049 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AmfrQ9R049 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AmfrQ9R049 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AmfrQ9R049 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AmfrQ9R049 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AmfrQ9R049 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AmfrQ9R049 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AmfrQ9R049 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AmfrQ9R049 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AmfrQ9R049 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AmfrQ9R049 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AmfrQ9R049 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
AmfrQ9R049 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AmfrQ9R049 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AmfrQ9R049 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AmfrQ9R049 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AmfrQ9R049 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AmfrQ9R049 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
AmfrQ9R049 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms