Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms