Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Copg1Q9QZE5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Copg1Q9QZE5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Copg1Q9QZE5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms