Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tnnt3Q9QZ47 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tnnt3Q9QZ47 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tnnt3Q9QZ47 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tnnt3Q9QZ47 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tnnt3Q9QZ47 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Tnnt3Q9QZ47 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tnnt3Q9QZ47 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tnnt3Q9QZ47 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tnnt3Q9QZ47 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tnnt3Q9QZ47 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tnnt3Q9QZ47 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Tnnt3Q9QZ47 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Tnnt3Q9QZ47 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tnnt3Q9QZ47 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tnnt3Q9QZ47 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tnnt3Q9QZ47 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tnnt3Q9QZ47 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tnnt3Q9QZ47 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tnnt3Q9QZ47 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tnnt3Q9QZ47 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tnnt3Q9QZ47 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tnnt3Q9QZ47 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Tnnt3Q9QZ47 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tnnt3Q9QZ47 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tnnt3Q9QZ47 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tnnt3Q9QZ47 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tnnt3Q9QZ47 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tnnt3Q9QZ47 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tnnt3Q9QZ47 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tnnt3Q9QZ47 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tnnt3Q9QZ47 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tnnt3Q9QZ47 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tnnt3Q9QZ47 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tnnt3Q9QZ47 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tnnt3Q9QZ47 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Tnnt3Q9QZ47 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tnnt3Q9QZ47 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tnnt3Q9QZ47 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tnnt3Q9QZ47 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tnnt3Q9QZ47 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tnnt3Q9QZ47 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tnnt3Q9QZ47 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tnnt3Q9QZ47 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tnnt3Q9QZ47 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tnnt3Q9QZ47 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tnnt3Q9QZ47 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tnnt3Q9QZ47 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tnnt3Q9QZ47 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tnnt3Q9QZ47 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tnnt3Q9QZ47 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tnnt3Q9QZ47 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tnnt3Q9QZ47 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tnnt3Q9QZ47 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tnnt3Q9QZ47 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tnnt3Q9QZ47 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tnnt3Q9QZ47 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tnnt3Q9QZ47 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tnnt3Q9QZ47 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tnnt3Q9QZ47 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tnnt3Q9QZ47 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tnnt3Q9QZ47 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tnnt3Q9QZ47 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tnnt3Q9QZ47 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tnnt3Q9QZ47 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tnnt3Q9QZ47 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnnt3Q9QZ47 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnnt3Q9QZ47 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnnt3Q9QZ47 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnnt3Q9QZ47 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnnt3Q9QZ47 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tnnt3Q9QZ47 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tnnt3Q9QZ47 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tnnt3Q9QZ47 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tnnt3Q9QZ47 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tnnt3Q9QZ47 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tnnt3Q9QZ47 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tnnt3Q9QZ47 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tnnt3Q9QZ47 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tnnt3Q9QZ47 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tnnt3Q9QZ47 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tnnt3Q9QZ47 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tnnt3Q9QZ47 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tnnt3Q9QZ47 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tnnt3Q9QZ47 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tnnt3Q9QZ47 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tnnt3Q9QZ47 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnnt3Q9QZ47 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnnt3Q9QZ47 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnnt3Q9QZ47 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnnt3Q9QZ47 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnnt3Q9QZ47 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnnt3Q9QZ47 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnnt3Q9QZ47 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tnnt3Q9QZ47 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms