Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Rdh11Q9QYF1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rdh11Q9QYF1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rdh11Q9QYF1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rdh11Q9QYF1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rdh11Q9QYF1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rdh11Q9QYF1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rdh11Q9QYF1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Rdh11Q9QYF1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rdh11Q9QYF1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
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Rdh11Q9QYF1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rdh11Q9QYF1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rdh11Q9QYF1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Rdh11Q9QYF1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Rdh11Q9QYF1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Rdh11Q9QYF1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Rdh11Q9QYF1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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Rdh11Q9QYF1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
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Rdh11Q9QYF1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rdh11Q9QYF1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rdh11Q9QYF1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rdh11Q9QYF1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rdh11Q9QYF1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rdh11Q9QYF1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rdh11Q9QYF1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rdh11Q9QYF1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rdh11Q9QYF1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rdh11Q9QYF1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Rdh11Q9QYF1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rdh11Q9QYF1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rdh11Q9QYF1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rdh11Q9QYF1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rdh11Q9QYF1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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Rdh11Q9QYF1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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