Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY33

Tspan3, Tetraspanin-3, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3Q9QY33 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tspan3Q9QY33 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan3Q9QY33 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan3Q9QY33 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan3Q9QY33 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan3Q9QY33 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan3Q9QY33 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan3Q9QY33 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan3Q9QY33 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tspan3Q9QY33 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tspan3Q9QY33 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tspan3Q9QY33 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tspan3Q9QY33 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tspan3Q9QY33 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tspan3Q9QY33 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tspan3Q9QY33 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tspan3Q9QY33 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tspan3Q9QY33 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tspan3Q9QY33 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tspan3Q9QY33 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tspan3Q9QY33 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tspan3Q9QY33 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tspan3Q9QY33 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tspan3Q9QY33 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tspan3Q9QY33 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tspan3Q9QY33 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tspan3Q9QY33 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tspan3Q9QY33 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tspan3Q9QY33 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tspan3Q9QY33 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan3Q9QY33 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan3Q9QY33 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan3Q9QY33 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan3Q9QY33 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan3Q9QY33 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan3Q9QY33 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tspan3Q9QY33 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan3Q9QY33 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms