Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkp3Q9QY23 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pkp3Q9QY23 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pkp3Q9QY23 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms