Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nr2e3Q9QXZ7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nr2e3Q9QXZ7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nr2e3Q9QXZ7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nr2e3Q9QXZ7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nr2e3Q9QXZ7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms