Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Kcnip3Q9QXT8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kcnip3Q9QXT8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms