Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpsf3Q9QXK7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpsf3Q9QXK7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpsf3Q9QXK7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpsf3Q9QXK7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpsf3Q9QXK7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpsf3Q9QXK7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpsf3Q9QXK7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpsf3Q9QXK7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpsf3Q9QXK7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpsf3Q9QXK7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cpsf3Q9QXK7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cpsf3Q9QXK7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cpsf3Q9QXK7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cpsf3Q9QXK7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cpsf3Q9QXK7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cpsf3Q9QXK7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpsf3Q9QXK7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpsf3Q9QXK7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpsf3Q9QXK7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpsf3Q9QXK7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpsf3Q9QXK7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpsf3Q9QXK7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpsf3Q9QXK7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpsf3Q9QXK7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpsf3Q9QXK7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpsf3Q9QXK7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpsf3Q9QXK7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpsf3Q9QXK7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpsf3Q9QXK7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpsf3Q9QXK7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpsf3Q9QXK7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpsf3Q9QXK7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpsf3Q9QXK7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpsf3Q9QXK7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpsf3Q9QXK7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpsf3Q9QXK7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpsf3Q9QXK7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpsf3Q9QXK7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpsf3Q9QXK7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpsf3Q9QXK7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpsf3Q9QXK7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpsf3Q9QXK7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cpsf3Q9QXK7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpsf3Q9QXK7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms