Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Apbb1Q9QXJ1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Apbb1Q9QXJ1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Apbb1Q9QXJ1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Apbb1Q9QXJ1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Apbb1Q9QXJ1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Apbb1Q9QXJ1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Apbb1Q9QXJ1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Apbb1Q9QXJ1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Apbb1Q9QXJ1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Apbb1Q9QXJ1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Apbb1Q9QXJ1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Apbb1Q9QXJ1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Apbb1Q9QXJ1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Apbb1Q9QXJ1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Apbb1Q9QXJ1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Apbb1Q9QXJ1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Apbb1Q9QXJ1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Apbb1Q9QXJ1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Apbb1Q9QXJ1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Apbb1Q9QXJ1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Apbb1Q9QXJ1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Apbb1Q9QXJ1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Apbb1Q9QXJ1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Apbb1Q9QXJ1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Apbb1Q9QXJ1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Apbb1Q9QXJ1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Apbb1Q9QXJ1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Apbb1Q9QXJ1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Apbb1Q9QXJ1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Apbb1Q9QXJ1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Apbb1Q9QXJ1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Apbb1Q9QXJ1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Apbb1Q9QXJ1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Apbb1Q9QXJ1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Apbb1Q9QXJ1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Apbb1Q9QXJ1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Apbb1Q9QXJ1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Apbb1Q9QXJ1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Apbb1Q9QXJ1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Apbb1Q9QXJ1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Apbb1Q9QXJ1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Apbb1Q9QXJ1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Apbb1Q9QXJ1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Apbb1Q9QXJ1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Apbb1Q9QXJ1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Apbb1Q9QXJ1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Apbb1Q9QXJ1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Apbb1Q9QXJ1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Apbb1Q9QXJ1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Apbb1Q9QXJ1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Apbb1Q9QXJ1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Apbb1Q9QXJ1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Apbb1Q9QXJ1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Apbb1Q9QXJ1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Apbb1Q9QXJ1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Apbb1Q9QXJ1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Apbb1Q9QXJ1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Apbb1Q9QXJ1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Apbb1Q9QXJ1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Apbb1Q9QXJ1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Apbb1Q9QXJ1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Apbb1Q9QXJ1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Apbb1Q9QXJ1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Apbb1Q9QXJ1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Apbb1Q9QXJ1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Apbb1Q9QXJ1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Apbb1Q9QXJ1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Apbb1Q9QXJ1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Apbb1Q9QXJ1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Apbb1Q9QXJ1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Apbb1Q9QXJ1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Apbb1Q9QXJ1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Apbb1Q9QXJ1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Apbb1Q9QXJ1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Apbb1Q9QXJ1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Apbb1Q9QXJ1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Apbb1Q9QXJ1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Apbb1Q9QXJ1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Apbb1Q9QXJ1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Apbb1Q9QXJ1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Apbb1Q9QXJ1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Apbb1Q9QXJ1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Apbb1Q9QXJ1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Apbb1Q9QXJ1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Apbb1Q9QXJ1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Apbb1Q9QXJ1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Apbb1Q9QXJ1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Apbb1Q9QXJ1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Apbb1Q9QXJ1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Apbb1Q9QXJ1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Apbb1Q9QXJ1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Apbb1Q9QXJ1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Apbb1Q9QXJ1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Apbb1Q9QXJ1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Apbb1Q9QXJ1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Apbb1Q9QXJ1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Apbb1Q9QXJ1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Apbb1Q9QXJ1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Apbb1Q9QXJ1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms