Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim44Q9QXA7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trim44Q9QXA7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim44Q9QXA7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim44Q9QXA7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim44Q9QXA7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim44Q9QXA7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim44Q9QXA7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim44Q9QXA7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim44Q9QXA7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim44Q9QXA7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim44Q9QXA7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim44Q9QXA7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim44Q9QXA7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim44Q9QXA7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim44Q9QXA7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim44Q9QXA7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim44Q9QXA7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim44Q9QXA7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim44Q9QXA7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim44Q9QXA7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim44Q9QXA7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim44Q9QXA7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim44Q9QXA7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trim44Q9QXA7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms