Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chaf1aQ9QWF0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chaf1aQ9QWF0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Chaf1aQ9QWF0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chaf1aQ9QWF0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chaf1aQ9QWF0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chaf1aQ9QWF0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chaf1aQ9QWF0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chaf1aQ9QWF0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chaf1aQ9QWF0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chaf1aQ9QWF0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chaf1aQ9QWF0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chaf1aQ9QWF0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chaf1aQ9QWF0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chaf1aQ9QWF0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chaf1aQ9QWF0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chaf1aQ9QWF0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chaf1aQ9QWF0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chaf1aQ9QWF0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chaf1aQ9QWF0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Chaf1aQ9QWF0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chaf1aQ9QWF0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chaf1aQ9QWF0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chaf1aQ9QWF0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chaf1aQ9QWF0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chaf1aQ9QWF0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chaf1aQ9QWF0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chaf1aQ9QWF0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chaf1aQ9QWF0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Chaf1aQ9QWF0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chaf1aQ9QWF0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chaf1aQ9QWF0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chaf1aQ9QWF0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chaf1aQ9QWF0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Chaf1aQ9QWF0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Chaf1aQ9QWF0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chaf1aQ9QWF0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chaf1aQ9QWF0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chaf1aQ9QWF0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chaf1aQ9QWF0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chaf1aQ9QWF0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chaf1aQ9QWF0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chaf1aQ9QWF0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chaf1aQ9QWF0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chaf1aQ9QWF0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chaf1aQ9QWF0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chaf1aQ9QWF0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chaf1aQ9QWF0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chaf1aQ9QWF0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chaf1aQ9QWF0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chaf1aQ9QWF0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chaf1aQ9QWF0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chaf1aQ9QWF0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chaf1aQ9QWF0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chaf1aQ9QWF0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chaf1aQ9QWF0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chaf1aQ9QWF0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.7 ms