Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM83

Calm4, Calmodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm4Q9JM83 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calm4Q9JM83 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calm4Q9JM83 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calm4Q9JM83 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Calm4Q9JM83 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calm4Q9JM83 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calm4Q9JM83 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calm4Q9JM83 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calm4Q9JM83 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Calm4Q9JM83 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calm4Q9JM83 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calm4Q9JM83 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calm4Q9JM83 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calm4Q9JM83 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calm4Q9JM83 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calm4Q9JM83 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calm4Q9JM83 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calm4Q9JM83 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Calm4Q9JM83 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Calm4Q9JM83 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Calm4Q9JM83 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Calm4Q9JM83 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Calm4Q9JM83 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms