Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SrfQ9JM73 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SrfQ9JM73 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SrfQ9JM73 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms