Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cul3Q9JLV5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cul3Q9JLV5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cul3Q9JLV5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cul3Q9JLV5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms