Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dclk1Q9JLM8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dclk1Q9JLM8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dclk1Q9JLM8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dclk1Q9JLM8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dclk1Q9JLM8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Dclk1Q9JLM8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dclk1Q9JLM8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dclk1Q9JLM8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dclk1Q9JLM8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dclk1Q9JLM8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dclk1Q9JLM8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dclk1Q9JLM8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dclk1Q9JLM8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dclk1Q9JLM8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dclk1Q9JLM8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dclk1Q9JLM8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dclk1Q9JLM8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dclk1Q9JLM8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Dclk1Q9JLM8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Dclk1Q9JLM8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Dclk1Q9JLM8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Dclk1Q9JLM8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dclk1Q9JLM8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dclk1Q9JLM8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dclk1Q9JLM8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dclk1Q9JLM8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dclk1Q9JLM8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dclk1Q9JLM8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dclk1Q9JLM8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dclk1Q9JLM8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dclk1Q9JLM8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dclk1Q9JLM8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dclk1Q9JLM8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dclk1Q9JLM8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dclk1Q9JLM8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dclk1Q9JLM8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dclk1Q9JLM8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dclk1Q9JLM8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dclk1Q9JLM8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dclk1Q9JLM8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dclk1Q9JLM8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dclk1Q9JLM8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Dclk1Q9JLM8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dclk1Q9JLM8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dclk1Q9JLM8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Dclk1Q9JLM8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dclk1Q9JLM8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dclk1Q9JLM8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dclk1Q9JLM8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Dclk1Q9JLM8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dclk1Q9JLM8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Dclk1Q9JLM8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dclk1Q9JLM8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dclk1Q9JLM8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dclk1Q9JLM8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dclk1Q9JLM8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dclk1Q9JLM8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dclk1Q9JLM8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dclk1Q9JLM8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Dclk1Q9JLM8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dclk1Q9JLM8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dclk1Q9JLM8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dclk1Q9JLM8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dclk1Q9JLM8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Dclk1Q9JLM8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dclk1Q9JLM8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dclk1Q9JLM8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dclk1Q9JLM8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dclk1Q9JLM8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dclk1Q9JLM8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dclk1Q9JLM8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dclk1Q9JLM8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dclk1Q9JLM8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Dclk1Q9JLM8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Dclk1Q9JLM8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dclk1Q9JLM8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dclk1Q9JLM8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dclk1Q9JLM8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dclk1Q9JLM8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dclk1Q9JLM8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dclk1Q9JLM8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Dclk1Q9JLM8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dclk1Q9JLM8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dclk1Q9JLM8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dclk1Q9JLM8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dclk1Q9JLM8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dclk1Q9JLM8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dclk1Q9JLM8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dclk1Q9JLM8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dclk1Q9JLM8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dclk1Q9JLM8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dclk1Q9JLM8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dclk1Q9JLM8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dclk1Q9JLM8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dclk1Q9JLM8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dclk1Q9JLM8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dclk1Q9JLM8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Dclk1Q9JLM8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Dclk1Q9JLM8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms