Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK4

Cabp2, Calcium-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp2Q9JLK4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cabp2Q9JLK4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cabp2Q9JLK4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cabp2Q9JLK4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cabp2Q9JLK4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cabp2Q9JLK4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cabp2Q9JLK4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cabp2Q9JLK4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cabp2Q9JLK4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cabp2Q9JLK4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cabp2Q9JLK4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cabp2Q9JLK4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cabp2Q9JLK4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Cabp2Q9JLK4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cabp2Q9JLK4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cabp2Q9JLK4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cabp2Q9JLK4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cabp2Q9JLK4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cabp2Q9JLK4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Cabp2Q9JLK4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cabp2Q9JLK4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cabp2Q9JLK4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cabp2Q9JLK4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cabp2Q9JLK4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Cabp2Q9JLK4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cabp2Q9JLK4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cabp2Q9JLK4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cabp2Q9JLK4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Cabp2Q9JLK4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cabp2Q9JLK4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cabp2Q9JLK4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cabp2Q9JLK4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cabp2Q9JLK4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cabp2Q9JLK4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cabp2Q9JLK4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cabp2Q9JLK4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cabp2Q9JLK4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cabp2Q9JLK4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cabp2Q9JLK4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cabp2Q9JLK4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cabp2Q9JLK4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cabp2Q9JLK4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cabp2Q9JLK4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cabp2Q9JLK4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cabp2Q9JLK4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cabp2Q9JLK4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cabp2Q9JLK4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cabp2Q9JLK4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cabp2Q9JLK4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cabp2Q9JLK4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cabp2Q9JLK4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cabp2Q9JLK4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cabp2Q9JLK4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cabp2Q9JLK4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Cabp2Q9JLK4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Cabp2Q9JLK4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cabp2Q9JLK4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cabp2Q9JLK4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cabp2Q9JLK4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cabp2Q9JLK4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cabp2Q9JLK4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cabp2Q9JLK4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cabp2Q9JLK4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cabp2Q9JLK4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cabp2Q9JLK4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cabp2Q9JLK4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cabp2Q9JLK4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cabp2Q9JLK4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cabp2Q9JLK4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Cabp2Q9JLK4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Cabp2Q9JLK4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cabp2Q9JLK4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cabp2Q9JLK4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cabp2Q9JLK4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cabp2Q9JLK4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cabp2Q9JLK4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cabp2Q9JLK4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cabp2Q9JLK4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cabp2Q9JLK4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cabp2Q9JLK4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cabp2Q9JLK4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cabp2Q9JLK4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cabp2Q9JLK4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cabp2Q9JLK4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cabp2Q9JLK4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cabp2Q9JLK4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cabp2Q9JLK4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cabp2Q9JLK4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cabp2Q9JLK4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cabp2Q9JLK4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cabp2Q9JLK4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cabp2Q9JLK4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cabp2Q9JLK4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cabp2Q9JLK4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cabp2Q9JLK4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cabp2Q9JLK4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Cabp2Q9JLK4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Cabp2Q9JLK4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cabp2Q9JLK4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cabp2Q9JLK4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms