Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC6

Tef, Thyrotroph embryonic factor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefQ9JLC6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TefQ9JLC6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TefQ9JLC6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TefQ9JLC6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TefQ9JLC6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TefQ9JLC6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TefQ9JLC6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TefQ9JLC6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TefQ9JLC6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TefQ9JLC6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TefQ9JLC6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TefQ9JLC6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TefQ9JLC6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TefQ9JLC6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TefQ9JLC6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TefQ9JLC6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TefQ9JLC6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TefQ9JLC6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TefQ9JLC6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TefQ9JLC6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TefQ9JLC6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TefQ9JLC6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TefQ9JLC6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TefQ9JLC6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TefQ9JLC6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TefQ9JLC6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TefQ9JLC6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TefQ9JLC6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TefQ9JLC6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TefQ9JLC6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TefQ9JLC6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TefQ9JLC6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TefQ9JLC6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TefQ9JLC6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TefQ9JLC6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TefQ9JLC6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TefQ9JLC6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TefQ9JLC6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TefQ9JLC6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TefQ9JLC6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TefQ9JLC6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TefQ9JLC6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TefQ9JLC6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TefQ9JLC6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TefQ9JLC6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TefQ9JLC6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TefQ9JLC6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TefQ9JLC6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TefQ9JLC6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TefQ9JLC6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TefQ9JLC6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TefQ9JLC6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TefQ9JLC6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TefQ9JLC6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TefQ9JLC6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TefQ9JLC6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TefQ9JLC6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TefQ9JLC6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TefQ9JLC6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TefQ9JLC6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms