Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Arl6ip1Q9JKW0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Arl6ip1Q9JKW0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Arl6ip1Q9JKW0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Arl6ip1Q9JKW0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Arl6ip1Q9JKW0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Arl6ip1Q9JKW0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Arl6ip1Q9JKW0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Arl6ip1Q9JKW0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Arl6ip1Q9JKW0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Arl6ip1Q9JKW0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arl6ip1Q9JKW0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arl6ip1Q9JKW0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arl6ip1Q9JKW0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arl6ip1Q9JKW0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Arl6ip1Q9JKW0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arl6ip1Q9JKW0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arl6ip1Q9JKW0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arl6ip1Q9JKW0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arl6ip1Q9JKW0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arl6ip1Q9JKW0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arl6ip1Q9JKW0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arl6ip1Q9JKW0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arl6ip1Q9JKW0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Arl6ip1Q9JKW0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arl6ip1Q9JKW0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arl6ip1Q9JKW0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arl6ip1Q9JKW0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arl6ip1Q9JKW0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Arl6ip1Q9JKW0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Arl6ip1Q9JKW0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms