Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Scamp4Q9JKV5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Scamp4Q9JKV5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Scamp4Q9JKV5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.6 ms