Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL4

Ndufaf3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf3Q9JKL4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ndufaf3Q9JKL4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ndufaf3Q9JKL4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ndufaf3Q9JKL4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms