Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV4

Cacng4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng4Q9JJV4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cacng4Q9JJV4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacng4Q9JJV4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacng4Q9JJV4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacng4Q9JJV4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacng4Q9JJV4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacng4Q9JJV4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacng4Q9JJV4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cacng4Q9JJV4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacng4Q9JJV4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacng4Q9JJV4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacng4Q9JJV4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacng4Q9JJV4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacng4Q9JJV4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacng4Q9JJV4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacng4Q9JJV4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacng4Q9JJV4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cacng4Q9JJV4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacng4Q9JJV4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacng4Q9JJV4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacng4Q9JJV4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cacng4Q9JJV4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacng4Q9JJV4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacng4Q9JJV4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cacng4Q9JJV4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacng4Q9JJV4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacng4Q9JJV4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacng4Q9JJV4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacng4Q9JJV4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacng4Q9JJV4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cacng4Q9JJV4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacng4Q9JJV4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacng4Q9JJV4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cacng4Q9JJV4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cacng4Q9JJV4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cacng4Q9JJV4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cacng4Q9JJV4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacng4Q9JJV4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cacng4Q9JJV4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cacng4Q9JJV4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cacng4Q9JJV4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacng4Q9JJV4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacng4Q9JJV4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacng4Q9JJV4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacng4Q9JJV4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacng4Q9JJV4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacng4Q9JJV4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacng4Q9JJV4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms