Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJC9

Herpud2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud2Q9JJC9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Herpud2Q9JJC9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Herpud2Q9JJC9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Herpud2Q9JJC9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Herpud2Q9JJC9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Herpud2Q9JJC9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Herpud2Q9JJC9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Herpud2Q9JJC9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Herpud2Q9JJC9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Herpud2Q9JJC9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Herpud2Q9JJC9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Herpud2Q9JJC9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Herpud2Q9JJC9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Herpud2Q9JJC9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Herpud2Q9JJC9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms