Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Kcnip1Q9JJ57 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kcnip1Q9JJ57 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kcnip1Q9JJ57 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms