Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smco4Q9JIS3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smco4Q9JIS3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smco4Q9JIS3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco4Q9JIS3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco4Q9JIS3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco4Q9JIS3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco4Q9JIS3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco4Q9JIS3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco4Q9JIS3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco4Q9JIS3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco4Q9JIS3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco4Q9JIS3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco4Q9JIS3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco4Q9JIS3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smco4Q9JIS3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smco4Q9JIS3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Smco4Q9JIS3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smco4Q9JIS3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Smco4Q9JIS3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms