Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gtf2ird1Q9JI57 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2ird1Q9JI57 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2ird1Q9JI57 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2ird1Q9JI57 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gtf2ird1Q9JI57 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2ird1Q9JI57 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2ird1Q9JI57 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2ird1Q9JI57 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2ird1Q9JI57 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2ird1Q9JI57 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2ird1Q9JI57 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gtf2ird1Q9JI57 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2ird1Q9JI57 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gtf2ird1Q9JI57 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms