Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EefsecQ9JHW4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
EefsecQ9JHW4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EefsecQ9JHW4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms