Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS9

Cwc15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc15Q9JHS9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cwc15Q9JHS9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cwc15Q9JHS9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cwc15Q9JHS9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cwc15Q9JHS9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cwc15Q9JHS9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cwc15Q9JHS9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cwc15Q9JHS9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cwc15Q9JHS9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cwc15Q9JHS9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cwc15Q9JHS9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cwc15Q9JHS9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cwc15Q9JHS9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cwc15Q9JHS9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cwc15Q9JHS9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cwc15Q9JHS9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cwc15Q9JHS9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cwc15Q9JHS9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cwc15Q9JHS9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cwc15Q9JHS9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cwc15Q9JHS9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cwc15Q9JHS9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cwc15Q9JHS9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cwc15Q9JHS9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cwc15Q9JHS9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cwc15Q9JHS9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cwc15Q9JHS9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cwc15Q9JHS9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cwc15Q9JHS9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cwc15Q9JHS9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cwc15Q9JHS9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cwc15Q9JHS9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cwc15Q9JHS9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cwc15Q9JHS9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cwc15Q9JHS9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cwc15Q9JHS9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cwc15Q9JHS9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cwc15Q9JHS9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cwc15Q9JHS9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cwc15Q9JHS9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cwc15Q9JHS9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cwc15Q9JHS9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cwc15Q9JHS9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cwc15Q9JHS9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cwc15Q9JHS9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cwc15Q9JHS9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cwc15Q9JHS9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cwc15Q9JHS9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cwc15Q9JHS9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cwc15Q9JHS9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cwc15Q9JHS9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cwc15Q9JHS9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cwc15Q9JHS9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc15Q9JHS9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc15Q9JHS9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc15Q9JHS9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc15Q9JHS9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc15Q9JHS9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc15Q9JHS9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc15Q9JHS9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc15Q9JHS9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cwc15Q9JHS9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cwc15Q9JHS9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cwc15Q9JHS9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms