Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI7

Exosc9, Exosome complex component RRP45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc9Q9JHI7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Exosc9Q9JHI7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Exosc9Q9JHI7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Exosc9Q9JHI7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Exosc9Q9JHI7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Exosc9Q9JHI7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Exosc9Q9JHI7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Exosc9Q9JHI7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Exosc9Q9JHI7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Exosc9Q9JHI7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Exosc9Q9JHI7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Exosc9Q9JHI7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Exosc9Q9JHI7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Exosc9Q9JHI7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Exosc9Q9JHI7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Exosc9Q9JHI7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Exosc9Q9JHI7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Exosc9Q9JHI7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Exosc9Q9JHI7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Exosc9Q9JHI7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Exosc9Q9JHI7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Exosc9Q9JHI7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Exosc9Q9JHI7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Exosc9Q9JHI7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Exosc9Q9JHI7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Exosc9Q9JHI7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Exosc9Q9JHI7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Exosc9Q9JHI7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Exosc9Q9JHI7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Exosc9Q9JHI7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Exosc9Q9JHI7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Exosc9Q9JHI7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Exosc9Q9JHI7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Exosc9Q9JHI7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Exosc9Q9JHI7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Exosc9Q9JHI7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Exosc9Q9JHI7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Exosc9Q9JHI7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Exosc9Q9JHI7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Exosc9Q9JHI7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Exosc9Q9JHI7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Exosc9Q9JHI7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Exosc9Q9JHI7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Exosc9Q9JHI7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Exosc9Q9JHI7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Exosc9Q9JHI7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Exosc9Q9JHI7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Exosc9Q9JHI7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Exosc9Q9JHI7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Exosc9Q9JHI7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Exosc9Q9JHI7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Exosc9Q9JHI7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Exosc9Q9JHI7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Exosc9Q9JHI7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Exosc9Q9JHI7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Exosc9Q9JHI7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Exosc9Q9JHI7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms