Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcirg1Q9JHF5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tcirg1Q9JHF5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tcirg1Q9JHF5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tcirg1Q9JHF5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tcirg1Q9JHF5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcirg1Q9JHF5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcirg1Q9JHF5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcirg1Q9JHF5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcirg1Q9JHF5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcirg1Q9JHF5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcirg1Q9JHF5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcirg1Q9JHF5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcirg1Q9JHF5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcirg1Q9JHF5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcirg1Q9JHF5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcirg1Q9JHF5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcirg1Q9JHF5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcirg1Q9JHF5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcirg1Q9JHF5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tcirg1Q9JHF5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tcirg1Q9JHF5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tcirg1Q9JHF5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tcirg1Q9JHF5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tcirg1Q9JHF5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tcirg1Q9JHF5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tcirg1Q9JHF5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcirg1Q9JHF5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcirg1Q9JHF5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcirg1Q9JHF5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcirg1Q9JHF5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcirg1Q9JHF5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcirg1Q9JHF5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcirg1Q9JHF5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcirg1Q9JHF5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcirg1Q9JHF5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcirg1Q9JHF5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcirg1Q9JHF5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcirg1Q9JHF5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcirg1Q9JHF5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcirg1Q9JHF5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcirg1Q9JHF5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcirg1Q9JHF5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcirg1Q9JHF5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcirg1Q9JHF5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.3 ms