Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX2

Sp6, Transcription factor Sp6, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp6Q9ESX2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Sp6Q9ESX2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sp6Q9ESX2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms