Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESJ4

Nckipsd, NCK-interacting protein with SH3 domain, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NckipsdQ9ESJ4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NckipsdQ9ESJ4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NckipsdQ9ESJ4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NckipsdQ9ESJ4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NckipsdQ9ESJ4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NckipsdQ9ESJ4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NckipsdQ9ESJ4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NckipsdQ9ESJ4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NckipsdQ9ESJ4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NckipsdQ9ESJ4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NckipsdQ9ESJ4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NckipsdQ9ESJ4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NckipsdQ9ESJ4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NckipsdQ9ESJ4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NckipsdQ9ESJ4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NckipsdQ9ESJ4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NckipsdQ9ESJ4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NckipsdQ9ESJ4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NckipsdQ9ESJ4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NckipsdQ9ESJ4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NckipsdQ9ESJ4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NckipsdQ9ESJ4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NckipsdQ9ESJ4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NckipsdQ9ESJ4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NckipsdQ9ESJ4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NckipsdQ9ESJ4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NckipsdQ9ESJ4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NckipsdQ9ESJ4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NckipsdQ9ESJ4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NckipsdQ9ESJ4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NckipsdQ9ESJ4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NckipsdQ9ESJ4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NckipsdQ9ESJ4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NckipsdQ9ESJ4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NckipsdQ9ESJ4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NckipsdQ9ESJ4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NckipsdQ9ESJ4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NckipsdQ9ESJ4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NckipsdQ9ESJ4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NckipsdQ9ESJ4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NckipsdQ9ESJ4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NckipsdQ9ESJ4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NckipsdQ9ESJ4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NckipsdQ9ESJ4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NckipsdQ9ESJ4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NckipsdQ9ESJ4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NckipsdQ9ESJ4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NckipsdQ9ESJ4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NckipsdQ9ESJ4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NckipsdQ9ESJ4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NckipsdQ9ESJ4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NckipsdQ9ESJ4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NckipsdQ9ESJ4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NckipsdQ9ESJ4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NckipsdQ9ESJ4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NckipsdQ9ESJ4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NckipsdQ9ESJ4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NckipsdQ9ESJ4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
NckipsdQ9ESJ4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NckipsdQ9ESJ4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NckipsdQ9ESJ4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms