Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ms4a4bQ9ES61 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a4bQ9ES61 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ms4a4bQ9ES61 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms