Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim54Q9ERP3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim54Q9ERP3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim54Q9ERP3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim54Q9ERP3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim54Q9ERP3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim54Q9ERP3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim54Q9ERP3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim54Q9ERP3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim54Q9ERP3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim54Q9ERP3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim54Q9ERP3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim54Q9ERP3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim54Q9ERP3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim54Q9ERP3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim54Q9ERP3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim54Q9ERP3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim54Q9ERP3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim54Q9ERP3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim54Q9ERP3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim54Q9ERP3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms