Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn12Q9ER56 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn12Q9ER56 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn12Q9ER56 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn12Q9ER56 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn12Q9ER56 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn12Q9ER56 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn12Q9ER56 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn12Q9ER56 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms