Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SyncQ9EPM5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SyncQ9EPM5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SyncQ9EPM5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SyncQ9EPM5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SyncQ9EPM5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SyncQ9EPM5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SyncQ9EPM5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SyncQ9EPM5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SyncQ9EPM5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SyncQ9EPM5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SyncQ9EPM5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SyncQ9EPM5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SyncQ9EPM5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SyncQ9EPM5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SyncQ9EPM5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SyncQ9EPM5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SyncQ9EPM5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SyncQ9EPM5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SyncQ9EPM5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SyncQ9EPM5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SyncQ9EPM5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SyncQ9EPM5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SyncQ9EPM5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SyncQ9EPM5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms