Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP97

Senp3, Sentrin-specific protease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp3Q9EP97 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Senp3Q9EP97 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Senp3Q9EP97 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Senp3Q9EP97 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Senp3Q9EP97 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Senp3Q9EP97 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Senp3Q9EP97 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Senp3Q9EP97 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Senp3Q9EP97 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Senp3Q9EP97 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Senp3Q9EP97 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Senp3Q9EP97 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Senp3Q9EP97 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Senp3Q9EP97 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Senp3Q9EP97 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Senp3Q9EP97 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Senp3Q9EP97 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Senp3Q9EP97 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms