Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xab2Q9DCD2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Xab2Q9DCD2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xab2Q9DCD2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xab2Q9DCD2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xab2Q9DCD2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xab2Q9DCD2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xab2Q9DCD2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xab2Q9DCD2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xab2Q9DCD2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xab2Q9DCD2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xab2Q9DCD2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xab2Q9DCD2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xab2Q9DCD2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xab2Q9DCD2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xab2Q9DCD2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xab2Q9DCD2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xab2Q9DCD2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xab2Q9DCD2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xab2Q9DCD2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xab2Q9DCD2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xab2Q9DCD2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xab2Q9DCD2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xab2Q9DCD2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xab2Q9DCD2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xab2Q9DCD2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Xab2Q9DCD2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xab2Q9DCD2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xab2Q9DCD2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xab2Q9DCD2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xab2Q9DCD2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xab2Q9DCD2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Xab2Q9DCD2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Xab2Q9DCD2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Xab2Q9DCD2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Xab2Q9DCD2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Xab2Q9DCD2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Xab2Q9DCD2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms