Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC3

Cmtr1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtr1Q9DBC3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cmtr1Q9DBC3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cmtr1Q9DBC3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cmtr1Q9DBC3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms