Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB10

Smdt1, Essential MCU regulator, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smdt1Q9DB10 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smdt1Q9DB10 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smdt1Q9DB10 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smdt1Q9DB10 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smdt1Q9DB10 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Smdt1Q9DB10 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smdt1Q9DB10 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smdt1Q9DB10 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smdt1Q9DB10 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smdt1Q9DB10 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smdt1Q9DB10 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smdt1Q9DB10 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smdt1Q9DB10 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smdt1Q9DB10 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Smdt1Q9DB10 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smdt1Q9DB10 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smdt1Q9DB10 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smdt1Q9DB10 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smdt1Q9DB10 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smdt1Q9DB10 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Smdt1Q9DB10 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smdt1Q9DB10 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smdt1Q9DB10 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smdt1Q9DB10 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smdt1Q9DB10 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smdt1Q9DB10 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smdt1Q9DB10 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smdt1Q9DB10 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smdt1Q9DB10 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 188.9 ms