Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAE8

UPF0739 protein C1orf74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAE8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9DAE8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9DAE8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9DAE8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9DAE8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9DAE8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9DAE8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9DAE8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9DAE8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9DAE8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9DAE8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9DAE8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms