Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA3

Uncharacterized protein C4orf36 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAA3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q9DAA3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9DAA3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9DAA3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DAA3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9DAA3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9DAA3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DAA3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9DAA3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms